| 1987年底 |
「花蓮善牧協會」成立。 |
| 1990年 |
「花蓮善牧協會」更名為「花蓮善牧中心」。 |
| 1991年 |
「花蓮善牧中心」正式納入財團法人台灣基督教門諾會聯會運作。 |
| 1992年 |
向台灣基督長老教會美南差會租得宣教士宿舍，作為辦公室，同時收容不幸少女，收容場所命名為「善牧園」。 |
| 1993年 |
「善牧園」更名為「希望園」。 |
| 1993年 |
社區教育部門成立，開始實施原住民社區青少年夜間課業輔導。 |
| 1994年 |
「花蓮善牧中心」正式向內政部申請立案，成立「財團法人台灣基督教門諾會附設花蓮縣私立善牧中心」 |
| 1994年 |
希望園遷至自購公寓，使收容之少女能安置在安全、隱密的獨立宿舍。 |
| 1995年 |
社區部門正式開辦「蓮花方案」，於暑假期間進行原住民社區兒童、青少年的營隊活動。 |
| 1995年 |
與金車教育基金會合辦「用愛點亮後山希望」系列活動。 |
| 1996年 |
開設「茉莉家園」，安置受暴婦女及特殊個案。 |
| 1997年 |
推動兒童自我保護方案。 |
| 1998年 |
爭取「中途學校」之設立。 |
| 1998年 |
獲選第二屆促進原住民社會發展有功團體。 |
| 1999年 |
「九二一大地震」後，針對南投災區，發動大規模的賑災活動。 |
| 1999年 |
榮獲台灣省績優兒童少年福利團體。 |
| 2000年 |
與縣政府洽談進駐花蓮縣社會福利館事宜。 |
| 2001年3月 |
辦公室遷入現址（花蓮市文苑路12號6樓），繼續推動原有事工。 |
| 2001年 |
桃芝颱風過境，針對光復鄉大興村災區，展開各項救災事宜。 |
| 2001年10月 |
於舊辦公室(美南差會宣教士宿舍)成立「飛炫屋」青少年活動中心。 |
| 2002年 |
中心榮獲教育部頒發「九十年度青少年輔導計畫績優學校暨有功人員」獎。 |
| 2003年 |
正式成立「未婚媽媽中途之家」，推動尊重生命各項宣導事宜。 |
| 2003年 |
中途之家辦理「外籍新娘」關懷外展服務。 |
| 2003年7月 |
「飛炫屋」青少年活動中心搬遷至現址：花蓮市中美路61號。
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